1、序列中包含过多的疏水性氨基酸
一般来讲序列中有50%的疏水性氨基酸可大概判断为较难溶序列（较短的序列除外），更多的疏水性氨基酸不利于合成的粗品纯度提高，对于纯化的溶解制备都是较大的困难，一般需在纯度上沟通好。
2、重复序列
重复序列会造成合成困难，容易形成性质相近的残肽，从而在纯化时较难分离。
3、未知修饰
对于特殊修饰、客户提供特殊小分子等，即便是合成方法的理论可行，不代表实验一定成功，确定时需多做考虑，将可能问题体现讲清楚，避免不必要的纠纷。
4、长肽
所有的合成反应，效率都不能达到*对的100%，序列越长，产生的副反应和杂质也越多，正确率、收率都会大大降低，目前我们公司在长肽的合成积累了大量的经验，理论上尽量不要超过60aa长度，超过80aa长度的，考虑到合成难度、成本等，一般*还是采用生物合成。
5、磷酸化修饰
根据合成经验，3或4个的磷酸化修饰位点合成难度大大增加，更多的磷酸化成功率较低，一般只能做小量合成，合成周期、价格也会大幅提升，另外磷酸化修饰的位点不宜相近或相连，靠近序列的N端对降低合成难度有利。
6、多对二硫键成环
二硫键的环化会降低序列的溶解性，对于客户要求多对（3-4对）二硫键成环的序列多为天然序列，非天然序列会存在配对错误的可能，此为环化过程的难点，另外多对二硫键收率都较低，合成时间跟价格也会大幅提升。
7、首尾酰胺环
序列中氨基酸组合对首尾酰胺环的成功率影响较大，含Asp和Glu的序列可选择固相环化，成功率较高，对于液相首尾酰胺环，序列中含D型氨基酸有利于成环。
8、二肽或三肽的合成
短肽的合成往往收率较低，合成的困难在于裂解后，粗肽无法经乙醚析出，纯化的困难在于含95%TFA的裂解液不能直接应用于制备，另外短肽极性较大，较难吸附制备柱，造成合成和纯化的困难。
国肽生物主要提供：多肽合成、多肽定制、同位素标记肽、人工胰岛素、磷酸肽、生物素标记肽、荧光标记肽（Cy3、Cy5、Fitc、AMC等）、目录肽、偶联蛋白（KLH、BSA、OVA等）、美容肽、化妆品肽、多肽文库构建、抗体服务、糖肽、订书肽、药物肽、RGD环肽等。详情请咨询国肽生物 |
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