根据《高新技术企业认定管理办法》 第四条 ：依据本办法认定的高新技术企业，可依照《企业所得税法》及其《实施条例》、《中华人民共和国税收征收管理法》（以下称《税收征管法》）及《中华人民共和国税收征收管理法实施细则》（以下称《实施细则》）等有关规定，申请享受税收优惠政策。而相关的税收优惠，主要是《中华人民共和国所得税法》（2008年1月1日执行）第二十八条规定：国家需要重点扶持的高新技术企业，减按15%的税率征收企业所得税。
由此可见，优惠的，主要是企业所得税，按照15%的税率进行征收。 并无营业税或者增值税的相关优惠。而单纯从税种来说，营业税和增值税都是属于流转税的一种，增值税的税是随着产品流动，对高新技术企业的影响不大，而营业税主要是征收第三产业的税，高新技术企业一般为第二产业，涉及面较少。所以政策的制定，主要是 以企业所得税优惠为主，也是比较符合支持企业创新发展的政策目的的。
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