铜管内的生物污染的预防在冷却水中含有水藻、微生物、浮游生物，甚至还有蚌类、贻贝、藤壶等大的生物，这是凝汽器冷却面上粘附有机附着物的主要原因。这些生物不断从冷却水得到营养，便可继续生长。生长的快慢与水中有机污染的程度、生存条件有关，主要与温度有关，一般以20-30°C为宜，过高的水温则会死亡。对清洁的管壁，则生长缓慢。粘附物呈灰绿色或褐红色粘膜状态，有腥臭味，为防止生物污染的产生，可考虑采用下列一些措施。
一、加氯处理
定期向凝汽器中加氯，是一种方便有效消除生物污染的方法。在加氯后，可以很快使一些浮游生物枯萎、中毒死去，加长加氯时间，亦可使较大生物死去。
氯由于廉价，使用方便，故大多数电厂选用其作为控制生物污染的手段。
加氯一般用液态氯，因不易控制浓度，不能将液态氯直接加入水中，应经减压气化(在30°C下减压至0.6MPa即气化)后进入氯气瓶中，但仍不能直接加人水中，宜先用一射水抽气器，用水抽出气态氯、水与氯相混合稀释后再加入水中。加入的量维持加入冷却水后氯的浓度、加氯持续时间和周期，都得经试验确定。过高的浓度不单是浪费问题，并且还可能引起铜管的腐蚀。
液态氯泄漏时会发生重大事故，故对液态氯的运输和保存有一定的要求，因而有些厂使用次氯酸钙(漂白粉)。次氯酸钙虽使用方便，但对商品漂白粉应注意活性氯的含量，一般只有20％-30％，有效部分少，使用后，循环水中会行较多残渣。
二、依次局部加氯
以住在冷却水加氯以消除生物污染时，是在凝汽器前隔一距离(保证氯在水中分布均匀)的进水管中加入，为保证一定的杀菌效果，在冷却水出水中保持氯的一定浓度，例如2mg/L。但冷却水中的残余氯的徘放将受到环保条例的限制，例如美国环保局允许徘放水中的残余氯要求降低至0.2mg/L以下，并且每台机组每天只允许排放2h，这就迫使电厂改变加氯方式。合理的解决办法是局部管束中通入含一定氯浓度的水并维持一定时间，使这局部受热面中的生物染物被清除。而总的冷却水出口的氯浓度很小，甚至少到几乎测不出、以满足环保的排放标准，还可采用固定喷嘴法和移动喷嘴法，使整个受热面依次轮流受到加氯清洗，闭定喷嘴法是每处受热面都有固定喷嘴组喷出含氯的水冲洗，只是在外面依次向各固定喷嘴组供入含氯的水。移动喷嘴法可用旋转式——适用于圆形布置的凝汽器管束，亦可用直线移动法，用于长方式或带状布置的管束。
关于加氯的制度应根据试验确定，一般说浓度可以低一些、但每天加氮两次，效果比一次更好。例如，浓度为2mg/L，每次持续时间为7.5mim，每天两次，便可不发生生物污染。
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