发酵的方法是：
① 加水量的要求：将各种农业废弃物混合拌匀，加入适量的水．使含水量达到60～75％以上（一般要求的加水量为料水比为1︰2～3）。
② 碳氮比的要求：理论上要求碳氮比25～35︰1，发酵效果才比较好，但如果是农作物秸秆例如玉米秸秆等觉见秸秆的碳氮比为65～85︰1，碳素过高，不利于发酵，即使发酵完成，所生产的有机肥仍然碳氮比过高，如果施于农田，则可能产生土壤中的微生物与农作物争夺氮素的现象，造成农作物幼苗生长不好的缺点，例如麦苗会因缺氮而黄化、瘦弱，生长不良。
碳氮比的解决方法：在每2立方米秸秆中加入6～10公斤尿素一起发酵，尿素先溶解于水中加入；或加入10公斤磷酸二铵；或者加入200公斤一周内的动物粪尿都可以达到很好的调节碳氮比的效果，再加入秸秆腐熟剂；
如果是田间秸秆的凼沤发酵，则*好是把秸秆粗粉碎处理，秸秆粉碎后，在秸秆表面每亩撒施碳酸氢铵50公斤或尿素20公斤，再加入秸秆腐熟剂，然后耕翻。
③ 秸秆腐熟剂的加入量：国家要求每吨秸秆有机物至少加入2公斤的秸秆腐熟剂，但实际情况有所区别，国家的要求是针对正好符合国家农用微生物菌剂标准GB20287-2006的产品而言的，这种产品的微生物含菌量标准规定为0.5亿/克，但如果产品的微生物含量达到10亿/克以上的产品，则发酵一吨秸秆只需要100克就可以，堆肥快速腐熟剂的含菌量达到80亿/克，完全可以只用100克就达到快速腐熟的要求。
④ 发酵过程中操作要求：要求堆高不少于80公分，每次处理量不少于2立方米，太少则很难保温，要求在发酵过程中，至少翻堆两次为宜，目的是发酵中途补充空气，加速发酵进程；发酵堆温*高宜达到60度以上，并保持两天以上。
⑤ 除了加入上面说的尿素、或磷酸二铵、或动物粪便等来调节碳氮比外，建议加入过磷酸钙，加入量为每2立方米加入10公斤，或每吨秸秆料加入25公斤，过磷酸钙既是肥料又有除臭作用。
⑥ 必须指出的是，堆肥发酵是一种半好氧发酵模式，发酵过程中可以通过在中间插一把秸秆作为通气道，或翻堆两次的方法供空气； |
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