关于活性炭吸附除去有机物的效果，附着微生物以后是不利的。从微生物的大小与起吸附作用的微孔的物理性大小完全不同方面来看，很难想象微生物本身会堵塞孔隙。但是可以认为，由于微生物的附着，其代谢产物及其他有机物蓄积在活性炭表面上，通过其数量会对活性炭的吸附量及吸附速度产生影响。此外，还如学者的报告中所指出的那样，要处理的有机物质受到微生物分解及其他各种各样的分解以后，结果亲水性提高，不利于活性炭进行吸附。微生物附着在活性炭上所带来的利弊，应从处理工艺的总体上进行评价。
在活性炭上附着的微生物的定量方面，研究过的有示差热分析法、差分灰化法、多精类分析法以及基耶达分解法等。这些方法是基于测定活性炭与微生物的分解举动的差异性观点；或者是根据多糖类及氮是来自微生物的假定，以及基于用酸来分解活性炭活性炭以外的有机物的观点进行测定的。生物膜是由各种微生物形成的生态体系，而且即使是同一种微生物，也存在代谢活性炭有差异的场合。必须留意的是，在微生物的数目或者重量以外，也存在着与微生物分解的除去量有关系的其他因素。
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